Kabupaten Pamekasan terletak di tengah Pulau Madura, Jawa Timur dengan batas wilayah:
Utara: Laut Jawa
Selatan: Selat Madura
Timur: Kabupaten Sumenep
Barat: Kabupaten Sampang
Secara administratif Kabupaten Pamekasan terbagi menjadi 13 kecamatan, 11 kelurahan dan 178 desa, yaitu:
Kecamatan Tlanakan, terdiri dari 17 desa
Kecamatan Pademawu, terdiri dari 2 kelurahan dan 20 desa
Kecamatan Galis, terdiri dari 10 desa
Kecamatan Pamekasan, terdiri dari 9 kelurahan dan 9 desa
Kecamatan Proppo, terdiri dari 27 desa
Kecamatan Palengaan, terdiri dari 12 desa
Kecamatan Pegantenan, terdiri dari 13 desa
Kecamatan Larangan, terdiri dari 14 desa
Kecamatan Kadur, terdiri dari 10 desa
Kecamatan Pakong, terdiri dari 12 desa
Kecamatan Waru, terdiri dari 12 desa
Kecamatan Batumarmar, terdiri dari 13 desa
Kecamatan Pasean, terdiri dari 9 desa
Wilayah Kabupaten Pamekasan seluas 792,30 km2. Secara garis besar terdiri dari dataran rendah pada bagian selatan
dan dataran tinggi di wilayah tengah dan utara. Wilayah tertinggi yaitu Kecamatan Pegantenan yang berada pada ketinggian 312 meter dpl,
sedangkan wilayah terendah yaitu Kecamatan Galis berada pada ketinggian 6 meter dpl.